Καθώς η Hetty υποβάλλει τα χαρτιά της για σύνταξη και εξαφανίζεται, η Shay Mosley έρχεται στο Λος Άντζελες για να επιβλέψει την ομάδα και κάνει αλλαγές στο προσωπικό. Ο Sam επιμένει ότι ο Callen πρέπει να βρει νέο συνεργάτη.
Όταν η κόρη ενός διαβόητου παραχαράκτη καταφτάνει στο Λος Άντζελες, ο Sam μετατρέπεται σε χρηματοοικονομικό σύμβουλο, ενώ ο Callen συνεργάζεται με την Anna για να ανακαλύψουν το πιο πρόσφατο σχέδιο της οικογένειας.
Στη διάρκεια μιας έρευνας για τη δολοφονία μιας υποπλοιάρχου που βρισκόταν σε άδεια στο Λος Άντζελες, η ομάδα ανακαλύπτει εμπιστευτικά έγγραφα παρακολούθησης τα οποία είχε φέρει παράνομα στην πόλη, ίσως για να τα πουλήσει σε ξένο αγοραστή.
Όταν ένας πιλότος της αεροπορίας με τον οποίο έβγαινε η Kensi πριν μια δεκαετία παραβιάζει εγκαταστάσεις εκτόξευσης πυραύλων, η Kensi μεταφέρεται στην τοποθεσία για να αποτρέψει τη χρήση πυρηνικών όπλων.
Όταν η πράκτορας της CIA Joelle Taylor ξεφεύγει από τον απαγωγέα της και στρέφεται στον Callen για βοήθεια, ο Callen και η ομάδα έχουν αμφιβολίες για την ιστορία που αφηγείται.
Η ομάδα εντοπίζει μια επιδέξια εγκληματία η οποία είναι αποφασισμένη να πάρει εκδίκηση για τον θάνατο του πατέρα της σκοτώνοντας έναν Βραζιλιάνο διπλωμάτη.
Ενώ η Hetty βασανίζεται από τους απαγωγείς της στο Βιετνάμ, ο Eric και η Nell βρίσκουν ένα στοιχείο για το πού μπορεί να βρίσκεται, κάνοντας την ομάδα να οργανώσει μια αποστολή διάσωσης με πολύ λίγες πληροφορίες.
Ο Callen, ο Sam, η Kensi και ο Deeks συνεργάζονται με την ομάδα της Hetty από τον πόλεμο του Βιετνάμ σε μια επικίνδυνη και άτυπη αποστολή διάσωσης της Hetty από τους απαγωγείς της.
Ο Callen και ο Sam βγάζουν από την προστασία μαρτύρων την πρώην κατάσκοπο Jennifer Kim, κόρη του Granger, για να βοηθήσει την ομάδα να εντοπίσει έναν υπόγειο κατάσκοπο που έχει στα χέρια του πυρηνικό οπλοστάσιο.
Ο Callen αναζητά όλες τις εναλλακτικές όταν η Υπηρεσία Διπλωματικής Ασφάλειας συλλαμβάνει τον πατέρα του στα πλαίσια ανταλλαγής δύο Αμερικανών φωτογράφων που κρατούνται όμηροι στο Ιράν.
Ο Callen και ο Sam συνεργάζονται με την Anna Kolcheck και τη Διεύθυνση Αλκοόλ, Καπνού, Πυροβόλων Όπλων και Εκρηκτικών όταν ο Arkady Kolchec προειδοποιεί την ομάδα ότι ένας διαβόητος διεθνής έμπορος όπλων έχει επιστρέψει στις ΗΠΑ.
Μετά την κλοπή 10 εκατομμυρίων δολαρίων σε κωδικούς Bitcoin από φάρμα παραγωγής κρυπτονομίσματος, ο Sam και η Hidoko ξεκινούν μια μυστική αποστολή, με τον Sam να υποδύεται έναν παλιό γνωστό που έχει αλλάξει στρατόπεδο.
Οι Callen, Sam και Nell ταξιδεύουν στο Angeles Forest για να αναζητήσουν κομμάτια ενός πυραύλου που απέτυχε να εκτοξευθεί, ανάμεσά τους και μια άκρως εμπιστευτική κυβερνητική συσκευή.
Ο Sam τραυματίζεται σε ανταλλαγή πυροβολισμών με ένα καρτέλ και ένας ύποπτος αποκαλύπτει νέα στοιχεία για το πού μπορεί να βρίσκεται ο Spencer Williams, ο άνδρας που απήγαγε τον γιο της Mosley πριν πέντε χρόνια.
Παρά τις σοβαρές αντιρρήσεις πολλών μελών της NCIS, η ομάδα ταξιδεύει στο Μεξικό για μια ριψοκίνδυνη αποστολή εντοπισμού και διάσωσης του γιου της Mosley.
