Ο Γιάννης Χουβαρδάς γεννήθηκε το 1950.
Το 1975 αποφοίτησε από την Royal Academy of Dramatic Art του Λονδίνου, ενώ σπούδασε δραματολογία και σκηνοθεσία στο Κρατικό Θέατρο της Βυρτεμβέργης.

Υπήρξε συνιδρυτής, σκηνοθέτης και ηθοποιός στη Θεατρική Συντεχνία, 1977-1980. Έχει περιοδεύσει σε πολλά φεστιβάλ της Ελλάδας και του εξωτερικού, ενώ οργάνωσε το διεθνές φεστιβάλ «Διεθνείς Ημέρες Ανοιχτού Θεάτρου», με εναλλακτικά θεατρικά συγκροτήματα.

Από το 1977 μέχρι το 1990 συνεργάστηκε με εθνικά και κρατικά θέατρα της Ελλάδας και του εξωτερικού και ανέβασε περισσότερα από 30 έργα.

Το 1991 ίδρυσε το Θέατρο του Νότου, έναν πολιτιστικό οργανισμό αφιερωμένο στην ανανεωτική δουλειά και στη διεθνή συνεργασία στον τομέα του θεάτρου έχοντας ανεβάσει έργα κλασσικών συγγραφέων. Παράλληλα, οργανώνει και διευθύνει το θέατρο, με το οποίο έχουν συνεργαστεί σημαντικότατοι Έλληνες και ξένοι θεατρικοί καλλιτέχνες.

Τα τελευταία έξι χρόνια σκηνοθετεί και πάλι στο εξωτερικό, ιδίως όπερες. Έχει συνεργαστεί με την Όπερα του Γκέτεμποργκ, την Όπερα της Κοπεγχάγης, το Βασιλικό Δραματικό Θέατρο της Σουηδίας, το Εθνικό Θέατρο της Νορβηγίας.

Ο Γιάννης Χουβαρδάς έχει διοριστεί καλλιτεχνικός διευθυντής στο Εθνικό Θέατρο,